Merseburg besaß wegen seiner drei Flüsse (Saale, Geisel, Klia) eine Reihe von Wassermühlen, von den denen einige schon früh erwähnt werden. Die Meuschauer Mühle befindet sich am östlichen Ufer der Saale zwischen Neumarkt und Meuschau, wohingegen die anderen Mühlen am westlichen Ufer lokalisiert sind. So erklärt sich auch ihr Name. Sie war in der Reihenfolge entlang der Saale nach der Rischmühle und der Neumarktmühle die dritte Mühle, der dann noch weiter nördlich die Königsmühle folgte. Neben der Mühle befindet sich die Schleuse (südlich, östlich) und das Wehr (nördlich). Das Mahlhaus in seinen heutigen Ausmaßen entstand im Jahr 1902, nachdem die Mühle der 1740er Jahre in diesem Jahr niederbrannte.
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